Na frase «Trata-se do mais novo software do grupo, o MC2, por ora de uso interno», emprega-se ora e não "hora", porque ora significa agora, que é este o significado na frase. Ora é aqui uma palavra do português antigo, sem h, embora provenha do latim hora-, hora.
Consulte o "Dicionário Aurélio", brasileiro e muitíssimo bom, que ele ensina ainda mais coisas.